UCSC Xena主要解决两个问题：
- genomics数据的可视化，无论是大型公开数据库还是自己的私人数据。
主要数据来自TCGA、ICGC、CCLE等；
所有可以进行可视化的数据都可以下载，而且这些数据被预处理过，可以直接下载使用；
可以比较方便的可视化私人数据。
这里对于私人数据集，基于可利用资源、安全性的诸多考虑，Xena将此分析过程放在本地进行。所以其交互模式如下图所示：
- 将私人数据和公开数据进行合并分析。
- 可以查看的数据类型有：Copy number variation、DNA methylation、Gene and exon expression、Protein expression、miRNA expression、Positional mutation和Phenotype/annotations；
- 另外一个整合的web分析工具--MuPIT，可以在3D蛋白质空间中查看变异。
UCSC Xena总体来说，为geneomics研究提供了一个快速实现的平台。一些简单的、即时性的可视化内容，或者分析单个或几个gene，可以直接使用UCSC Xena实现，无需下载、预处理数据。
当然，其功能相对于使用R、python分析来说，还是比较简单的，并且其主要目的在于快速的可视化，而不是复杂的数据分析。所以对于稍微复杂的数据分析流程、成百上千个genes的可视化等任务，其可能无法完成。而且在中国大陆使用的话，可能需要找个合适的时间（比如上午）。
UCSC Xena的各种功能众多，并且还储存了大量的可用precompiled data，所以这里我会分多篇文章进行介绍：
- ，UCSC Xena的基本操作等也在此处进行了介绍
- UCSC 统计图示，这个比较简单，就直接链接到tutorial了
另外，UCSC Xena的一些重要的内容，我也以链接的形式放到下面，方便访问：
UCSC Xena介绍的其他的项目：
- TumorMap，由UCSC开发的另一个项目。
- MuPIT，可以可视化mutation所带来的蛋白质的影响。
- Transcript View，可视化肿瘤样本（TCGA）和正常样本（GTEx）间的差异。
- Gene Sets Tool，比较了两个队列间癌症相关基因的somatic mutation和copy number。
