整个可视化界面有多个动态的spreadsheets组成，任何数据都可以形成一个spreadsheet。所有的spreadsheets横向排列在一起，使得每一行是相同的一个样本，便于查看样本间的趋势。样本会被排序，顺序是先按照最左边的spreadsheet上的值排序，然后依次向右逐步推进。
移动排序
我们可以通过拖动spreadsheet来改变spreadsheets间的顺序，从而改变样本排列的顺序。
放大功能
框选部分范围（部分样本或部分变量），将会放大选中的部分。点击页面顶部的Clear Zoom则取消放大。如果只想取消单个spreadsheet的放大显示，则点击spreadsheet中出现的红色x即可。
Tooltips
Tootip位于页面顶部，用来显示当前鼠标所指的数据的信息。
如果想要freeze住当前鼠标指定的数据的信息，可以使用'Alt+click'，unfreeze则点击右边的x即可。
Gene Signatures
即我们可以人为的创造多个gene expression的weighted sum作为一个spreadsheet。其具体做法如下所示：
注意事项：
+和-两边必须加空格- 必须选择Gene Expression
UCSC Xena官方基于TCGA Pan-Cancer计算了一些signatures：
- gene programs
- HRD score, genome-wide DNA damage footprint
- Immune Signature Scores (Denise Wolf et al)
- Stemness score (DNA methylation based)
- Stemness score (RNA based)
这些可以在Genomic型数据中（Show Adanced）中找到。
数据展示
样本的排序：
- 对于copy number数据，其使用整个gene regions上的值的平均值来排序。
- 对于mutation数据，使用其最早发生变异的position来进行排序。
对于以上两类数据，我们可以放大其部分，这样，排序的依据将依照这放大的部分进行。
整个spreadsheet的图示部分可以分为3个区域，即：
- gene/chromosome展示区
- 表达量展示区
- 图例区
1. gene/chromosome展示区
在输入数据时，使用gene名或probes来选择gene
绘制这个gene的transcript。其中CDS区域（coding DNA Sequence，编码序列）使用较高的black bar表示，UTR区域（untranslated Regions，位于mRNA两端的非编码序列）使用较矮的black bar表示，内含子区域（intron region，可变剪切切除的区域）单纯使用轴表示。
如果mutation数据，则可以选择是否显示内含子区域，注意，此时下面的变异点的可视化也会随之变化。
可以输入整个chromosome（chr1）、chromosome的arms（chr19q）或者chromosomes的定位（chr1:1-2000000）来得到gene区域的表示
这里所有的gene都会表示出来，也无法隐藏gene的intron region
因为许多gene其所占的在染色体上的区域会有重叠，所以这里使用了多行来表示。
2. 表达量展示区
这个区域主要是以heatmap的形式显式的。唯一的区别在于mutation的数据，其在对应的的发生图片的位点上使用不同颜色的点来表示。
还要注意，exon RNAseq数据和Rnaseq数据有所不同，exon数据单个gene会有多个值，分别代表每个exon的表达。
3. 图例区
在最下面，比如越红表示值越大，不同的mutation type使用不同的类型表示...
功能菜单
在spreadsheet的右上角，有一个下拉菜单，有许多其他功能，这些功能会在其他章节中分别介绍。
